Bones e Booth vengono chiamati ad indagare sull’esplosione dell’auto di un diplomatico mediorientale. I due devono scoprire se l’uomo era un terrorista o se è rimasto vittima di un omicidio. Le indagini degli investigatori partono dai familiari della vittima: il fratello e la ex moglie. I tecnici di laboratorio scoprono che entrambi i fratelli soffrivano di eruzioni cutanee al volto ed iniziano a fare delle ipotesi sul tipo di sostanza con la quale i due sono entrati in contatto. Scoperto un laboratorio per la costruzione di rudimentali bombe alla diossina nell’appartamento del fratello della vittima, egli diviene il principale sospettato e viene fermato all’interno di un centro commerciale con un colpo di pistola sparato da Booth, giusto un attimo prima che faccia detonare il suo ordigno.