La squadra con la collaborazione di Joanna Teague prosegue l’indagine contro “I Chiamati”. Durante l’episodio, dopo lunghe indagini il team riesce ad arrestare Sadiq Samar, mentre viene identificato il vero capo dell’organizzazione, Daniel Budd. Intanto Luke viene aiutato a fuggire per fare ritorno in Iraq dove viene inseguito da Gibbs, Joanna e DiNozzo. Vance interroga Samar e comprende che è imminente un attentato. Nel frattempo, mentre DiNozzo riceve una telefonata da Budd, Gibbs viene raggiunto dal piccolo Luke che gli spara due colpi di pistola, lasciandolo a terra gravemente ferito mentre si appresta ad ucciderlo.