L’NCIS risponde a una chiamata di emergenza dopo che Heather Dempsey, un artificiere della Marina, spara e uccide un intruso in casa sua. Dempsey inizialmente non collabora alle indagini, ma appare sempre più evidente che non era sola al momento dello scontro. Lo sconosciuto si rivela essere un importante funzionario dell’FBI con cui la marine ha una relazione, mentre l’intruso in realtà era un assassino venuto ad uccidere uno dei due. Successivamente la nostra squadra scopre che il fratello di Dempsey è stato colpito e paralizzato da un uomo in una guerra tra bande a cui è stato messo in custodia protettiva in cambio della sua testimonianza; utilizzando l’amante, Dempsey riesce a rintracciarlo per vendicarsi, ma Gibbs la fermerà in tempo.