Tre ambasciatori di pace vengono trovati impiccati e con le gole tagliate. L’accaduto viene rivendicato dalla quinta colonna. Erica, preoccupata dal fatto che tra quei ragazzi avrebbe potuto esserci suo figlio, decide di fermare gli estremisti della quinta colonna. Ryan dice che per fare questo devono trovare il loro capo Eli Cohn e decidono di usare padre Jack come esca per arrivare a lui. Nel frattempo l’FBI affianca un nuovo agente ad Erica, il quale risulta essere un suo vecchio amico e le fa notare che in tutti gli avvenimenti che riguardano i V c’è sempre una persona che emerge: padre Jack. Vanno quindi a parlarci senza ottenere risposte, ma il collega di Erica conferma i suoi sospetti su di lui.

Anna, preoccupata dagli eventi e dall’influenza che la religione ha sulle persone, si reca al Vaticano per parlare col Cardinale Wolichek, segretario di stato vaticano, portando con sé Chad Decker. Lì capisce che tra i preti c’è un agente dormiente dei V, il quale non si identifica, e cercando di capire il perché lo obbliga a partire con loro nel tentativo di sapere cosa ha scoperto sulle emozioni umane. Con velate minacce e con la scusa ufficiale di voler avvicinare i V alle religioni terrestri, chiede al Cardinale di impedire agli ecclesiastici di far prediche contro i V.

Intanto Erica, Ryan e Hobbes, seguendo Jack, arrivano a Eli Cohn: vogliono che non ci siano più vittime innocenti. Cohn spiega che la sua vendetta è dovuta al fatto che i V anni prima hanno fatto esperimenti sulla moglie incinta provocando la morte del figlio. Alla fine trovano un accordo: fornire due collaboratori di Cohn all’FBI che facciano da capri espiatori sia per la morte degli ambasciatori sia per la morte dell’agente Malik. Fingendo di trovare delle nuove prove, Erica si reca col suo nuovo collega al rifugio di Cohn, nel quale arrestano i due componenti della quinta colonna e dove trovano false prove della morte di Malik. Ryan provvede a nascondere il corpo dell’agente portando le prove della sua morte ad Anna, la quale continua a ricattarlo.

Nel tornare in chiesa padre Jack vede che hanno messo tutto sottosopra e nota una grossa V sul muro, a terra trova il cellulare di Tyler, capisce che è implicato nella faccenda, pertanto lo dice ad Erica mostrandole il cellulare, la quale oltre ad essere preoccupata per il comportamento del figlio, ignora che il suo nuovo collega è stato ingaggiato anche per indagare su di lei, fortemente sospettata dal suo capo di nascondere qualcosa, e nota che lei ha frequenti rapporti con Padre Jack.